MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 14022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016112	TTTG	2	8	1442396	1442403	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_016112	TGC	2	6	1442426	1442431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_016112	ACT	2	6	1442473	1442478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_016112	TAA	2	6	1443284	1443289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_016112	AAAT	2	8	1443290	1443297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_016112	TAA	2	6	1446420	1446425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_016112	TTC	2	6	1446446	1446451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_016112	CTG	2	6	1446701	1446706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_016112	ATG	2	6	1447646	1447651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_016112	ATT	3	9	1447681	1447689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_016112	TAA	2	6	1447712	1447717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_016112	GTAA	2	8	1449781	1449788	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_016112	T	6	6	1449818	1449823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_016112	TTG	2	6	1449826	1449831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_016112	TGT	2	6	1449860	1449865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_016112	GTCG	2	8	1449886	1449893	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4517	NC_016112	A	6	6	1450004	1450009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_016112	T	6	6	1450375	1450380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_016112	ATG	2	6	1450425	1450430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_016112	ATT	2	6	1450438	1450443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_016112	AAAGG	2	10	1450970	1450979	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_016112	GAGC	2	8	1451010	1451017	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4523	NC_016112	TGG	2	6	1451052	1451057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_016112	CGG	2	6	1451074	1451079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_016112	CAA	2	6	1451143	1451148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_016112	TTTA	2	8	1451170	1451177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_016112	T	6	6	1451206	1451211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_016112	AAT	2	6	1453450	1453455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_016112	TCG	2	6	1454726	1454731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_016112	CAT	2	6	1454736	1454741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_016112	CAT	2	6	1454743	1454748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_016112	CA	3	6	1454750	1454755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_016112	TCAAA	2	10	1454786	1454795	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4534	NC_016112	CTA	2	6	1454930	1454935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_016112	T	6	6	1454972	1454977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_016112	AAT	2	6	1456486	1456491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_016112	TATT	2	8	1456517	1456524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_016112	TAA	2	6	1456582	1456587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_016112	TAAT	2	8	1456615	1456622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_016112	TC	3	6	1459688	1459693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_016112	TGC	2	6	1459694	1459699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_016112	A	8	8	1459745	1459752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_016112	C	6	6	1459943	1459948	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4544	NC_016112	TTAAG	2	10	1459984	1459993	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_016112	CAC	2	6	1460079	1460084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_016112	CTTAA	2	10	1460091	1460100	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4547	NC_016112	AGTTA	2	10	1460232	1460241	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_016112	A	6	6	1460262	1460267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_016112	ATA	2	6	1460304	1460309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_016112	AGA	2	6	1460314	1460319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_016112	AAT	2	6	1460399	1460404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_016112	AT	3	6	1460416	1460421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_016112	TGTT	2	8	1460436	1460443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_016112	A	7	7	1460450	1460456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_016112	TGGCG	2	10	1460465	1460474	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4556	NC_016112	TAAA	2	8	1460496	1460503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_016112	CTATTG	2	12	1460520	1460531	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4558	NC_016112	ATAA	2	8	1460532	1460539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_016112	T	6	6	1460542	1460547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_016112	ATG	2	6	1460576	1460581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_016112	TGT	2	6	1460625	1460630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_016112	TGCA	2	8	1460657	1460664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_016112	TTG	2	6	1460728	1460733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_016112	T	6	6	1460738	1460743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_016112	GTT	2	6	1460757	1460762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_016112	TAA	2	6	1461832	1461837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_016112	T	7	7	1461879	1461885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_016112	G	10	10	1461892	1461901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_016112	AAT	2	6	1461966	1461971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_016112	T	7	7	1461973	1461979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_016112	TAA	2	6	1462082	1462087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_016112	A	6	6	1462086	1462091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_016112	AGG	2	6	1462132	1462137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_016112	GCA	2	6	1462405	1462410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_016112	CTA	2	6	1463706	1463711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_016112	ATG	2	6	1463828	1463833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_016112	CGG	2	6	1463884	1463889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_016112	GCC	2	6	1463898	1463903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_016112	TTAT	2	8	1463959	1463966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_016112	TTA	2	6	1463982	1463987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_016112	TAAA	2	8	1464026	1464033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_016112	T	7	7	1464046	1464052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_016112	T	7	7	1464177	1464183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_016112	A	6	6	1464197	1464202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_016112	ATA	2	6	1464216	1464221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_016112	ATT	2	6	1464277	1464282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_016112	G	7	7	1464340	1464346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_016112	TA	3	6	1466599	1466604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_016112	AGCTGG	2	12	1466807	1466818	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4590	NC_016112	A	6	6	1466944	1466949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_016112	GCA	2	6	1466994	1466999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_016112	CCTG	2	8	1467088	1467095	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_016112	CAC	2	6	1467113	1467118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4594	NC_016112	TCA	2	6	1467159	1467164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_016112	AGG	2	6	1467225	1467230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_016112	ATAC	2	8	1469120	1469127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4597	NC_016112	GC	3	6	1469148	1469153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_016112	CCAT	2	8	1469276	1469283	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_016112	CAC	2	6	1469297	1469302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4600	NC_016112	GAA	2	6	1469528	1469533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_016112	ATT	2	6	1470920	1470925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_016112	AAG	2	6	1470933	1470938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_016112	ATT	2	6	1470954	1470959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_016112	TTC	2	6	1470975	1470980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_016112	ATT	2	6	1471191	1471196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_016112	CGTC	2	8	1471230	1471237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_016112	AAT	3	9	1473103	1473111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_016112	TAA	2	6	1474171	1474176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_016112	ACA	2	6	1474202	1474207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_016112	TAA	2	6	1474297	1474302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_016112	ATG	2	6	1477547	1477552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_016112	AGCA	2	8	1477624	1477631	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4613	NC_016112	CTG	2	6	1478223	1478228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_016112	TCAAT	2	10	1478343	1478352	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4615	NC_016112	AGTT	2	8	1478715	1478722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_016112	TTG	2	6	1485383	1485388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_016112	GGC	2	6	1485443	1485448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_016112	TTA	2	6	1485450	1485455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_016112	ATT	2	6	1485514	1485519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_016112	TCAT	2	8	1485559	1485566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4621	NC_016112	GAC	2	6	1485841	1485846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_016112	TTG	2	6	1485917	1485922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_016112	T	6	6	1485969	1485974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_016112	GTT	2	6	1485992	1485997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_016112	CTC	2	6	1486013	1486018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_016112	CCG	2	6	1486068	1486073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_016112	TTG	2	6	1486099	1486104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_016112	ATA	2	6	1486123	1486128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_016112	CG	3	6	1486615	1486620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_016112	CGG	2	6	1487358	1487363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_016112	AAAT	2	8	1489864	1489871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_016112	TGA	2	6	1489906	1489911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_016112	TTG	2	6	1489939	1489944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4757	NC_016112	TGT	2	6	1531257	1531262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4775	NC_016112	T	6	6	1535602	1535607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4796	NC_016112	GGC	2	6	1540588	1540593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4804	NC_016112	TTTA	2	8	1542701	1542708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4805	NC_016112	C	6	6	1543629	1543634	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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